Родился в 1956 году в Одессе, закончил два высших учебных заведения, с 1987 года живёт в Израиле, главный редактор литературного журнала «Артикль». Автор 23 книг прозы, лауреат премии им. Юрия Нагибина, вручаемой Союзом писателей Израиля за лучшую книгу года, составитель поэтических альманахов «Поэты Большого Тель-Авива», «Левантийская корона». Член Международного ПЕН-клуба. В 2013 году награждён орденом «За возрождение России». Рассказы и повести Шехтера публикуются в израильских русскоязычных журналах «22», «Слово писателя», «Иерусалимский журнал»; в американской прессе (газеты «Форвертс», «Новое русское слово»), в канадском журнале «Эксодус», украинских журналах «Мория», «Мигдаль», в российских изданиях «Лехаим», «Алеф», «Особняк», «Новая Юность», «Сибирские огни» и др. Произведения Якова Шехтера переведены на иврит, английский, французский, польский, литовский языки. Его рассказ включён во Всемирную антологию мистической прозы, изданную в Бостоне на английском языке.